مشکل مالکیت مشترک با خوزستانی‌ها
استقلال به کدام وزارتخانه واگذار می‌شود؟
با صعود استقلال خوزستان به لیگ برتر مجموع تیم‌هایی که زیر نظر وزارت اقتصاد و دارایی قرار دارند به عدد دو رسیده است. هم استقلال تهران و هم استقلال خوزستان زیر نظر این وزارتخانه اداره می‌شوند و برای تأیید مجوز حرفه‌ای باید یکی از این دو تیم از زیر چتر حمایتی وزارت اقتصاد و دارایی خارج شود. گفته می‌شود باشگاه استقلال خوزستان به دلایلی قادر به خروج از زیر چتر حمایت وزارت اقتصاد و دارایی نیست و این باشگاه استقلال است که باید برای خود متولی جدیدی را پیدا کند! در همین راستا شنیده می‌شود که به احتمال زیاد باشگاه استقلال بار دیگر زیر نظر وزارت ورزش و جوانان اداره خواهد شد. هرچند که اکنون نیز بسیاری از تصمیم‌‌گیری‌های این باشگاه از سوی مسئولان وزارت ورزش انجام می‌شود اما روی کاغذ باشگاه استقلال زیر نظر وزارت اقتصاد و دارایی قرار دارد ولی با توجه به صعود استقلال خوزستان به لیگ برتر و همزمان شدن حضور دو تیم با یک متولی در لیگ برتر باشگاه استقلال باید تغییراتی در شکل اداره خود ایجاد کرده و زیر نظر یکی دیگر از وزارتخانه‌ها به طی طریق ادامه دهد. با توجه به اینکه هر سال باید مدارک باشگاه‌ها جهت تأیید کنفدراسیون فوتبال آسیا ارسال شود، باشگاه استقلال باید بسرعت تکلیف این موضوع را مشخص کند.