مراسم قرعه‌کشی مرحله اول جام حذفی با حضور سهیل مهدی مدیر مسابقات، غلامرضا بهروان مشاور سازمان لیگ، امیرحسین روشنک مسئول جام حذفی، مهرداد شفیعی مسئول لیگ دو، امیرحسین فراهانی و احسان خداوردی از کمیته مسابقات به صورت آنلاین و غیرحضوری برگزار شد. 

سهیل مهدی در ابتدای مراسم اعلام کرد: «جام حذفی جام حادثه‌هاست و ۲۵ نماینده استانی در این مرحله حضور دارند و در مسابقات جام حذفی هم تست‌های کرونا از تیم‌ها انجام خواهد شد.»

 امیرحسین روشنک مسئول مسابقات جام حذفی هم گفت: «تیم‌های حاضر در این مسابقات یک ودیعه ۱۰ میلیون تومانی باید ارائه کنند. در این مسابقات تیم‌ها ۵ تعویض دارند که در صورت وقت اضافه تعویض ششم هم انجام خواهد 

شد.»

 براساس قرعه‌کشی تیم‌ها حریفان خود را شناختند که در مرحله مقدماتی سه مسابقه به شرح زیر انجام می‌شود (نام تیم‌های میزبان اول آمده است).

زاگرس‌نشینان بختیاری- شهدای دوکوهه اندیمشک

پیام خراسان جنوبی ابوذر کنگان

برنده این دو مسابقه در مرحله اول با یکدیگر رقابت خواهند کرد.

هیأت فوتبال بانه فولاد هرمزگان

(برنده این مسابقه با تیم شهرداری انزلی که در مرحله اول با قرعه استراحت روبه‌رو شد بازی خواهد کرد.)

مسابقات مرحله مقدماتی در روزهای ۳۰ دی و اول بهمن برگزار می‌شود.

مرحله اول مسابقات این مرحله ۵ و ۶ بهمن برگزار می‌شود.

میعاد پارس‌آباد اردبیل پدیده ملکشاهی

ستارگان آژند آذربایجان ابوذر باشت

سرخ‌پوشان ساری کانیاوا اشنویه آذربایجان

داماش پارسه تهران وحدت البرز

هلال احمر گراش اتحاد روانسر کرمانشاه

شهرداری برد اسکن شاهین تهران

سوهان محمد قم ارمک کیش

پارما یدک اصفهان سیمان شاهرود

دارایی خرمدره زنجان استقلال راوی دلیجان

مسابقات مرحله دوم با حضور تیم‌های صعودکرده از مرحله اول و تیم‌های لیگ دسته دوم در روزهای ۱۸ و ۱۹ بهمن برگزار می‌شود. مسابقات مرحله سوم با حضور تیم‌های صعود کرده از مرحله قبل و ۱۸ تیم لیگ یک در روزهای 6 و 7 اسفند برگزار خواهد شد. 

مسابقات مرحله چهارم که مرحله یک شانزدهم جام حذفی است با حضور تیم‌های لیگ برتری در روزهای 20 و 21 اسفند 99 برگزار می‌شود.